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我们从纪念斯隆凯特琳癌症

中心获得了另外一对肺腺癌肿瘤正常细胞,用于全基因组测序。除患者外,所有样本的均从原发性肺癌切除标本的冰冻组织中获得,尸检时发现有肝转移。例肺腺癌诊断要么由外部组织库或合作者、提供的临床手术病理报告进行认证,要么由解剖病理学家通过内部审查、进行验证。麻省理工学院和哈佛大学布罗德研究所。由领导的专家委员会进行了第二轮病理学审查,

所有倾向于诊断为腺癌以外的肿瘤均从研究

中删除。其中一个肿瘤样本经审查被诊断为潜在混合性肺腺癌和大细胞神经内分泌癌。使用哈佛大学和麻省理工学院博德研究所批准的方案,获得了每个样本的知情同意和道德投票(机构审查委员会),和。有关样品制备的更多详细信息,请参见扩展实验程序。制备和质量控制我们使用了最近描述的标准协议(伯杰等人,查普曼等埃及电话号码表人,斯特兰斯基等人,)。使用定量试剂测量肿瘤和正常浓度。测序所需的最低浓度为μ。如果浓度,则需要乙醇沉淀并重新悬浮以增加浓度。凝胶电泳证实了高分子量>。所有肿瘤和正常样本(天然和产品)

的身份均通过个常见 圣地亚哥,加利福尼亚州

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)的质谱指纹基因分型确认,并与序列数据进行比较。 销售线索 为了进行验证实验,我们使用基于的全基因组扩增(、试剂盒)准备了每个样品的储备库。单核苷酸多态性芯片根据制造商的方案,使用全基因组人类阵列处理来自肿瘤和配对正常样本的天然基因组。用和酶消化,使用连接酶连接到相应的接头,扩增,使用磁珠纯化,标记、片段化并与数组。杂交后,洗涤阵列并用链霉亲和素藻红蛋白染色。阵列制备和扫描在布罗德研究所的实验室进行。使用进行数据预处理。

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